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细菌基因组DNA纯化试剂盒

规格:
100 preps

产品描述产品FAQs已发表文献

细菌基因组DNA纯化试剂盒

离心柱型

目录号:GF2302

产品内容

产品组成

GF2302 / (100 preps)

溶液GA (Buffer GA)

30 ml

溶液BG (Buffer BG)

60 ml

蛋白酶K (20mg/ml)

1.2 ml*2

漂洗液PW (Buffer PW)

30 ml(使用前请先加入120 ml无水乙醇)

洗脱缓冲液TB (Buffer TB)

30 ml

吸附柱CG1 (Spin Columns CG1)

100个

收集管(2 ml) (Collection Tubes 2ml)

100个

选配试剂

RNase A (100 mg/ml 货号:GF0201-01);溶菌酶A(50mg/ml 货号:GF0203-01)

储存条件

该试剂盒置于室温(15-25℃)干燥条件下,可保存12个月,更长时间的保存可置于2-8℃。2-8℃保存条件下,若溶液产生沉淀,使用前应将试剂盒内的溶液在室温放置一段时间,必要时可在37℃水浴中预热10min,以溶解沉淀。

产品简介

本试剂盒采用可以特异性结合DNA的离心吸附柱,和独特的缓冲液系统,能高效、专一吸附DNA,可有效去除杂质蛋白及细胞中其他有机化合物。不需要苯酚、氯仿等有机溶剂,安全方便;提取的基因组DNA片段大,纯度高,质量稳定可靠。

使用本试剂盒回收的DNA可适用于各种常规操作,包括酶切、PCR、文库构建、Southern杂交等实验。

提取得率

材料

提取量

DNA得率

细菌培养液

105—108cells

5-20μg

注意事项

1.样品应避免反复冻融,否则会导致提取的DNA片段较小且提取量也下降。

2.若溶液GA或溶液BG中有沉淀,可在37℃水浴中重新溶解,摇匀后使用。

3.所有离心步骤均为使用台式离心机,室温下离心。

操作步骤

使用前请先在漂洗液PW中加入无水乙醇,加入体积请参照瓶上的标签。

1. 取细菌培养液1-5 ml,10,000rpm (~11,500×g) 离心1 min,尽量吸净上清。

2. 向菌体沉淀中加入200μl缓冲液GA,振荡至菌体彻底悬浮。

注意:对于较难破壁的革兰氏阳性菌,可略过第2步骤,加入溶菌酶A进行破壁处理,具体方法为:用110 μl复合酶缓冲液LY(客户自备,Genefist,货号:RT401-11)彻底重悬菌体,加入50 μl溶菌酶A(客户自备,50 mg/ml,Genefist,货号:GF0203-01),37℃处理30min以上。如果需要去除RNA,可加入4μl RNA酶A(100mg/ml)溶液(客户自备,Genefist,货号:GF0201-01),振荡15sec,室温放置5 min。

3. 向管中加入20 μl蛋白酶K溶液,混匀。

4. 加入200μl溶液BG,振荡15sec,70℃放置10min,溶液应变清亮,简短离心以去除管盖内壁的水珠。

注意:加入溶液BG时可能会产生白色沉淀,一般70℃放置时会消失,不会影响后续实验。如溶液未变清亮,说明细胞裂解不彻底,可能导致提取DNA量少和提取出的DNA不纯。

5. 加入200μl无水乙醇,充分振荡混匀15sec,此时可能会出现絮状沉淀,简短离心以去除管盖内壁的水珠。

6. 将上一步所得溶液和絮状沉淀都加入一个吸附柱CG1中(吸附柱放入收集管中),12,000rpm(~13,400×g)离心30sec,倒掉废液,将吸附柱CG1放回收集管中。

7. 向吸附柱CG1中加入300μl溶液BG,12,000rpm(~13,400×g)离心30sec,倒掉废液,将吸附柱CG1放入收集管中。

8. 向吸附柱CG1中加入700μl漂洗液PW(使用前请先检查是否已加入无水乙醇),12,000rpm(~13,400×g)离心30sec,倒掉废液,将吸附柱CG1放入收集管中。

9. 重复操作步骤8。

10. 将吸附柱CG1放回收集管中,12,000rpm(~13,400×g)离心2min,倒掉废液。将吸附柱CG1置于室温放置数分钟,以彻底晾干吸附材料中残余的漂洗液。

注意:这一步的目的是将吸附柱中残余的漂洗液去除,以免影响后续的酶反应(酶切、PCR等)实验。

11. 将吸附柱CG1转入一个干净的离心管中,向吸附膜的中间部位悬空滴加50-200μl洗脱缓冲液TB,室温放置2-5min,12,000rpm(~13,400×g)离心2min,将溶液收集到离心管中。

12. 注意:洗脱液体积不应少于50μl,体积过小影响回收效率。洗脱液的pH值对于洗脱效率有很大影响。若用ddH2O做洗脱液应保证其pH值在7.0-8.5范围内,pH值低于7.0会降低洗脱效率;DNA产物应保存在-20℃,以防DNA降解。为增加基因组DNA的得率,可将离心得到的溶液再加入吸附柱CG1中,室温放置2min,12,000rpm(~13,400×g)离心2min。

DNA浓度及纯度检测

得到的基因组DNA片段的大小与样品保存时间、操作过程中的剪切力等因素有关。回收得到的DNA片段可用琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计检测浓度与纯度。

DNA应在OD260处有显著吸收峰,OD260值为1相当于大约50 μg/ml双链DNA、40 μg/ml单链DNA。

OD260/OD280比值应为1.7-1.9,如果洗脱时不使用洗脱缓冲液,而使用ddH2O,比值会偏低,因为pH值和离子存在会影响光吸收值,但并不表示纯度低。